Журнал "Алгоритмы, методы и системы обработки данных" был основан в 1996 году и издается силами коллектива кафедры "Информационные системы" Муромского института (филиала) федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования "Владимирский государственный университет имени Александра Григорьевича и Николая Григорьевича Столетовых".

В период 1996-2010гг. журнал выпускался в печатной форме, а начиная с 2011 года издается в форме электронного журнала.

С момента основания журнала на его страницах было опубликовано свыше 500-от статей, отражающих научные достижения более чем 400 исследователей России и стран постсоветского пространства.

Страницы журнала всегда в основном были предоставлены молодым исследователям, часто впервые вступающим в область научных исследований и поисков. Вместе с тем в журнале публиковали статьи и именитые ученые, которые делились в них последними достижениями научной мысли.

С 2010 года журнал зарегистрирован в международном центре сериальных изданий как периодическое печатное издание (ISSN 2220-4229) и как электронный ресурс (ISSN 2220-878X).

В 2011 году журнал включен в Российский индекс научного цитирования (РИНЦ).